1.法律责任不同

分公司的法律责任由总公司承担，子公司具有独立法人资格，子公司的法律责任由其自行承担。

子公司的建立一般需要复杂的程序，财务制度相对严格，必须独立开立账簿，并需要审计和证明。经营损失不能抵消母公司的利润，与母公司的交易往往是税务机关避税审查的关键内容。

2、不同的纳税方式

①分支机构不是独立纳税人分支机构，是指独立核算、开展全部或部分业务的分支机构，如分支机构、分支机构等。分支机构是企业的一部分，不具有独立的法人资格。《企业所得税法》第五十条规定：“居民企业在中国设立不具有法人资格的经营机构的，应当总结、计算、缴纳企业所得税。”总结税是指企业总部及其分支机构的经营收入，通过总结税务电报实现所得税的总结、计算和缴纳。

②子公司是独立纳税人，子公司对应母公司，是指由另一家公司（母公司）有效控制的下属公司或母公司直接或间接控制的一系列公司。子公司是具有独立法人资格的独立企业。

③各自的优缺点子公司应独立计算自己的损益，通常履行与其他居民企业相同的综合纳税义务，并享受国家为新成立公司提供的免税期或其他税收优惠政策。分公司可以与总公司汇总缴纳企业所得税，设立分支机构，由于不具备法人资格，总公司可以汇总缴纳企业所得税。这样，总分公司之间的损益就可以相互抵消，合理减轻总公司的税收负担。

3、不同的组织结构

分公司只有负责人，子公司有独立股东。

4、子公司可以独立贷款，分公司不能

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